OHSMS认证工作通常是借助第三方认证机构来完成的。所谓第三方认证机构是指由政府授权的具有认证资格的中介组织。第三方认证应由委托方或受审核方自愿申请，并遵循自愿原则，即委托方或受审核方自愿选择决定是否申请实行 OHSMS认证，自愿选择经政府授权的具有认证资格的任何一家认证机构。
1．认证机构的选择
委托方或受审核方根据经营和管理的需要，可能会对认证机构作出不同的选择，在挑选认证机构时，一般应从三方面的因素进行考虑。
(1)权威性。指OHSMS认证机构的知名度和影响力。一个用人单位通过某个具有很高知名度和广泛影响力的认证机构的OHSMS认证，将意味着建立的OHSMS的质量具有更为可靠的保证，具有更好的客观公正性。依据认证注册和认证标志使用管理规定，通过向社会各相关方进行宣传和广告，向社会相关方传递其健全的职业健康安全管理的信息，可以为用人单位树立良好的社会形象，在市场竞争中占得领先的优势，从而带来更大的社会效益和经济效益。
(2)价格。认证机构在收取认证费用时，除了考虑受审核用人单位的规模、经营的复杂性和风险的性质等因素外，不同认证机构在考虑对某一用人单位进行 OHSMS认证时，所确定的费用一般也是不同的。知名度较低的认证机构所要求的认证费用相对要低些，而权威性高的认证机构往往所需的认证费用也相对要高。这就要根据用人单位对费用价格的承受能力等具体实际情况来定。
(3)相关方的要求。出于贸易的需要，用人单位必须考虑所选择的认证机构是否为其相关方接受。通常，相关方对选择认证机构并没有国别、行业或地区等方面的要求，但有时也不排除相关方的某些特殊要求。例如，从事出口贸易较多的用人单位可能需要获得国际上有较大知名度的某家认证机构的认证，从事国内市场贸易的企业，只需要获得本国认证机构的认证，有的用人单位还从这两方面综合考虑，获得国内和国际认证组织的双重认证。
2．认证机构的作用
由于认证机构所进行的认证是第三方认证，具有客观公正性，代表了广大相关方的利益，因此，认证机构在体系认证过程中发挥着以下几方面的重要作用。
(1)对用人单位OHSMS的有效性和符合性作出客观评价。认证机构通过对用人单位的OHSMS进行审核，对OHSMS的运行情况作出正式结论，即是否符合OHSMS标准的要求，是否符合国家有关法律、法规和其他要求，这里所提到的其他要求指的是地方性法规、标准和要求以及行业标准和要求等。
判断OHSMS是否有效，主要考虑用人单位是否有一个能动的管理机制，即通过运行其OHSMS，能有效地实现其职业健康安全方针、目标和指标。通过对OHSMS的监测和测量、纠正和预防措施、内部审核和管理评审，能形成一套自我发现、自我纠正和自我完善的管理机制等。
(2)为相关方提供信任的依据。第三方认证已被看作是一个用人单位能否按照OHSMS标准的要求建立自身的OHSMS体系，并具有体系通常运行的保障能力的可靠标志，从而为潜在的承包方、投资方和社区居民等提供职业健康安全方面的客观公正的评价，使用人单位赢得相关方的信任。
在需要进行第二方审核认证的场合，第三方认证也为用人单位减少了不必要的麻烦，节省大量的监督检查费用。因为用人单位的活动、产品或服务往往有不同的相关方，倘若都需要进行重复性的第二方审核认证，则对相关方和用人单位将是一笔很大的费用。
(3)推动和不断完善职业健康安全管理体系
用人单位不断完善OHSMS是体系本身的内在要求，因为标准要求对持续改进作出承诺。在获得认证机构的认证后，将获得认证机构颁发的认证证书，认证证书的有效期限一般为3年，在证书有效期内必须定期(有时是不定期的)接受认证机构的监督审核，3年有效期满后，要进行复评，原国家经贸委[1999-[983号文《关于开展职业健康安全体系认证工作的通知》中规定：“获得认证证书的企业在每年1月份向认证机构报告其上一年度职业健康安全管理体系的运行情况及事故状况，对不按规定实施职业健康安全管理体系及事故频繁的企业，认证机构视情况收回其认证证书。”
因此，要想使认证证书的有效性持续下去，必须依据OHSMS的内在要求以及法律、法规和其他要求，对内部和外部新环境的发展变化，新法律、法规的出现作出及时的反应，不断地完善和发展其职业健康安全管理体系。
三、咨询机构的作用
用人单位建立职业健康安全管理体系，使其保持正常运行，并最终获得认证机构的认证是一个十分复杂的过程，它涉及到体系的策划、设计和体系文件的编写、组织机构的配置和人员、资源的支配等大量的工作。有的用人单位可能有成功实施ISO 9000以及ISO 14000的经验，内部人员对标准的理解和掌握较准确，对建立体系的一整套程序也有充分的了解，因而体系建立的主要工作可以依靠内部人员来完成。但对于大多数用人单位而言，这些工作的有效开展仅依靠自身条件是难以完成的，因而需要借助外部机构的力量，这就是职业健康安全管理体系咨询机构承担的任务。
咨询机构的根本任务就是帮助用人单位建立和实施职业健康安全管理体系，使其最终通过第三方认证。但用人单位应当清醒地认识到，聘请外部咨询机构的目的不是将自身建立职业健康安全管理体系的责任转移到咨询机构或咨询人员头上，咨询人员仅仅是在建立职业健康安全管理体系过程中起一个参谋和指导的作用，用人单位的各级管理者仍然需要身体力行地参与并领导建立职业健康安全管理体系各阶段的工作。
为使用人单位顺利地完成体系建立的各项工作，按期通过认证机构的认证注册，必须重视咨询机构在此过程中所发挥的重要作用，认真进行咨询机构及人员的挑选。
1．咨询机构的选择
对用人单位来说，选择一个信誉和能力俱佳的咨询机构无疑会给体系建立工作以及将来顺利通过认证带来很大的帮助。因此，在对咨询机构的服务进行挑选时，首先要核实该机构获得职业健康安全管理体系咨询的资格和允许咨询的业务范围，该机构在以往咨询中的水平和信誉，尤其是应该重点考虑该机构是否有一支高素质的咨询队伍。
2．对咨询人员的挑选
鉴于职业健康安全管理体系建立过程的复杂性，用人单位在聘请外部咨询人员时，应从以下几方面考虑：
(1)在与咨询机构或个人就职业健康安全管理体系咨询工作签订合同之前，应同时商定咨询人员的安排，用人单位应要求对方提供参与咨询工作人员的名单，并要求其出示资格证书的复印件；
(2)要了解咨询人员的经历和参与职业健康安全管理体系咨询和认证工作的业绩，一个经验丰富、业务精干、组织协调能力强的咨询人员(或小组)将会更加富有成效地解决OHSMS建立、运行和认证前期工作中一系列具体问题；
(3)用人单位有权拒绝不适合人员参加咨询，如出于保密或专业的考虑；
(4)用人单位应在正式咨询开始前，向咨询人员就其经营的性质、范围、规模和所涉及的产品、活动或服务等进行介绍，确保他们对即将建立的职业健康安全管理体系有一个总体概念，使其明确咨询过程中所面监的工作范围和活动的目标，并为他们完成咨询任务提供适当的人力、物力和财力支持；
(5)按要求和国际惯例，咨询人员不能又参与该企业的OHSMS认证工作。
3．咨询工作的内容
咨询工作的起点是开展OHSMS标准知识和有关的培训，与用人单位各级员工进行交流，形成共识，终点是确保所建立的职业健康安全管理体系能够有效地运行，为实现第三方认证做好前期准备工作，在职业健康安全管理体系咨询的全过程中，咨询机构需指导用人单位开展以下几方面的工作。
(1)开展建立和实施职业健康安全管理体系的普及教育和宣传贯彻工作 职业健康安全管理体系的成功实施和有效运行需要全体员工的共同参与和承诺，尤其是最高管理者的承诺，因此必须统一全体员工的思想，达到齐心协力，自觉贯彻执行职业健康安全管理体系标准的要求，达到全体员工积极参与的目的，也为今后工作的开展和沟通建立共同语言。
在标准普及和贯彻过程中，要使全体员工认识到：
①建立和实施职业健康安全管理体系，最终实现第三方认证的目的和意义；
②了解职业健康安全管理体系标准的由来和发展趋势；
③我国目前开展职业健康安全管理体系认证工作的情况；
④OHSMS的特点和基本内容；
⑤与国际上广泛开展的ISO 9000和ISO 14000标准系列认证的联系和区别；
⑥如何结合用人单位特点理解职业健康安全管理体系标准等。
(2)对内审员进行培训 职业健康安全管理体系的建立、实施和正常运行，
需要依靠一支专门的内审员队伍来开展具体工作，并在咨询机构的指导下，发挥以下几方面的作用：
①对0HSMS的运行进行监督。职业健康安全管理体系的正常运行需要持续地监控，才能发现问题，及时解决问题。这种持续的监控主要是通过内部审核来进行的，而实施内部审核正是依靠这样一支内审员队伍，从这个角度上讲，内审员的作用就是对职业健康安全管理体系的有效运行起监督员的作用；
②对0HSMS的保持和改进起参谋作用。内审员的工作不仅是通过内部审核发现问题，提出不符合项的理由，而且为受审核方纠正措施的提出、实施、完成及有效性检验出谋划策；
③在0HS管理方面起沟通领导和群众间的桥梁作用。在内审过程中，他们有与广大员工进行充分交流和接触的机会，一方面收集员工和相关方对职业健康安全管理方面的意见、要求和建议，通过管理者代表向上层反映；另一方面又把领导层关于OHS方针、目标和意图向全体员工进行传达、解释和贯彻，起沟通和桥梁作用；
④在外部审核中起内外接口作用。用人单位的内审员常常充当外部审核的陪同人员、联络员或观察员，从中了解对方的审核要求、审核方式和方法，将有关信息反馈给管理者代表或最高管理者，同时也向对方介绍本单位的实际情况，起着内外接口的作用；
⑤在OHSMS实施过程中起带头作用。内审员一般都有自己的本职工作，在自己的工作领域，内审员可带头认真执行和贯彻有关的OHSMS标准、管理手册和工作程序文件，成为贯彻实施职业健康安全管理体系的积极分子。
因此，OHSMS是否有效和完整，很大程度上取决于一支高素质的内审员队伍，一般来说，OHSMS内审员必须掌握以下4个方面的知识：
①0HSMS标准及其应用的知识；
②职业健康安全领域的基础知识和专业技术知识；
③职业健康安全法律、法规知识，特别是有关的0HS法律、法规知识；
④审核过程中一些国际惯例和习惯做法。
咨询机构在对职业健康安全管理体系进行策划和设计之前，必须培训一批合格的内审员，使用人单位依靠自身的人力和资源，完成体系建立的主要工作。
(3)指导企业进行职业健康安全管理体系的策划和设计企业建立职业健康安全管理体系的一个重要环节就是进行体系的策划和设计。咨询机构在咨询活动中需要指导企业开展以下工作。
①制定计划。职业健康安全管理体系的建立是一项十分复杂、难度较大的工程，对此应该根据用人单位的实际情况，确定整个体系从培训、策划和建立到第三方认证注册的时间进度，各个环节所需的资源(人力、物力、财力)，成立专门的工作班子，并明确分工，落实职责。
②指导用人单位进行初评，制定OHS方针，确定出目标和指标。对职业健康安全管理体系现状进行初始评估，并对调查结果进行分析，找出现行管理与标准之间的差距。咨询中还要根据了解的现状，合理地进行机构职责的分配以及人力和其他资源的配置。
③确定体系文件结构，列出体系各层次文件清单。
(4)指导进行体系文件的编写 职业健康安全管理体系的一个主要特征是文件化，体系的运行活动是依靠大量文件支撑的。一般来讲，职业健康安全管理体系文件分为3个层次，管理手册、程序文件和作业文件(作业指导书)。如何进行各层次文件的编写，理顺各层次文件之间的关系，处理好各层次的接口，是咨询活动的重要内容。
(5)指导职业健康安全管理体系试运行 咨询机构在完成上述工作之后，为使新建立的体系保持适宜、有效和协调，应对职业健康安全管理体系试运行阶段的工作进行指导，对暴露出的问题提出整改建议及措施，对如何开展内审和管理评审提出指导性的建议，为迎接外部正式审核，并获得第三方认证铺平道路。
(6)协助做好OHSMS认证前的准备工作 一般来说，OHSMS认证前的准备工作主要包括申请认证的办理、迎接现场审核。咨询机构应协助选择合适的认证机构，指导用人单位进行申请认证的办理。用人单位接到认证机构的现场审核通知书后，咨询机构应针对用人单位的实际情况，对有关人员进行迎检培训，对认证前各项工作的安排提出建设性意见。
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